Veškerý biomedicínský odpad, který má být autoklávován, musí být nejprve umístěn do schváleného a označeného autoklávového sáčku. Ostré předměty, jako jsou jehly a skalpely, musí být před sterilizací umístěny do schválené, označené nádoby na ostré předměty. Do sáčku nevkládejte ostré pipety nebo rozbité sklo. Tento odpad by měl být umístěn do krabic nebo kbelíků a autoklávován nebo sterilizován pomocí tekutého sterilizačního prostředku, jako je 10% chlornan sodný. Biomedicínský odpad, který má být sterilizován v autoklávu, musí mít indikátor, který dokazuje, že odpad byl autoklávován, než může být zlikvidován. Mnoho autoklávových sáčků je dodáváno s indikátorem, který po dokončení sterilizačního cyklu zobrazuje „AUTOCLAVED“. Indikátory musí být aplikovány na krabice a sudy před jejich autoklávováním a umístěním do koše. Potenciálně infekční odpad musí být označen jako „biohazard“ a mít na kontejneru připevněný štítek pro biologické nebezpečí. Při sterilizaci zdravotně nezávadných materiálů, jako jsou nezbytné předměty pro výzkumná zvířata, kultivační média a laboratorní vybavení ve sterilním prostředí, postačí neoznačené obyčejné nádoby.
Před spuštěním je třeba do autoklávového sáčku vložit přibližně 50 ml – 100 ml vody, aby se ve vaku usnadnila tvorba páry. Pokud je tato voda přirozeně přítomna v nákladu, není nutné přidávat další vodu. Autoklávové sáčky by měly být dobře zabaleny, aby se zabránilo rozlití, pokud k nim dojde. Pokud je však páska zabalena příliš těsně, může se uvnitř sáčku vytvořit tlak páry a způsobit jeho protržení. Nezdvojujte pytle na odpadky. Autoklávové sáčky jsou navrženy tak, aby byly propustné pro páru, ale dvojitý sáček zabrání proudění páry přes sáček. Nepřeplňujte sáček ani autokláv, protože špatný proud páry může narušit proces sterilizace. Nejlepší je nevkládat sáček přímo do autoklávu. Měly by být umístěny na nerezových nebo polypropylenových podnosech.
Při autoklávování tekutin nenaplňujte nádobu více než ze 75 %. To zajistí, že kapalina bude mít prostor pro expanzi, když se zahřeje. Protože použití páry ksterilizovatkapaliny mohou být problematické, je nejlepší použít chemické prostředky ke sterilizaci tekutého odpadu, pokud je to možné. Pokud se výzkumníci rozhodnou pro sterilizaci kapalin použít páru, nádoba obsahující kapalinu musí odolat podmínkám autoklávu. Lze použít nádoby z borosilikátového skla nebo polypropylenu. Ujistěte se, že jste povolili víko na nádobě, aby se během procesu vytvořil tlak. Během autoklávování vždy umístěte volné skleněné nádoby a nádoby s tekutinou do sekundárních nádob. Při odstraňování kapaliny z autoklávu používejte silné, žáruvzdorné rukavice, ochranné brýle a gumovou zástěru. U kapalných náplní musí být odvzdušňovací cyklus autoklávu nastaven velmi pomalu. To dává kapalině čas na ochlazení pod 100 stupňů, takže se při poklesu tlaku nevře. Po dokončení chodu pomalu otevřete dvířka a couvejte, dokud se pára nevypustí.
